萎缩性鼻炎作为一种弥漫性、萎缩性的鼻腔病变，如果不及时加以治疗会影响到患者的日常生活。因此在确诊萎缩性鼻炎过后一定要积极、尽快接受治疗。萎缩性的鼻炎治疗方式多种多样，主要可分为急性期治疗和一般治疗。
当病情处于急性感染期时，需要根据医生做完细菌培养后的结果并结合患者的药物敏感度测定结果来选择合适的口服抗生素药物进行治疗控制。
一般治疗也可分为药物治疗、手术治疗、中医及其他治疗。
药物治疗方面因为每个患者存在一定的差异，因此应该在医生的指导下制定个性化的治疗方案进行治疗。常用的药物包括：1.鼻腔冲洗药物，一般以生理盐水或高锰酸钾溶液作为主要的冲洗药物；2.润滑药物，植物油、鱼肝油、复方雌二醇滴鼻剂等都可以用来做润滑或者改善鼻腔症状；3.抗生素药物，可以选用金霉素软膏类药物来保护黏膜，抑制细菌生长。
如果患者的病情发展比较严重，通过保守治疗也就是药物治疗的效果并不是很理想的时候可以考虑进行手术治疗。手术主要以缩小鼻腔、减少水分的蒸发、减轻过度通气、缓解鼻腔结痂等为目的。主要的手术方法有鼻腔粘-骨膜下埋藏术、前鼻孔闭合术以及鼻腔外侧壁内移加固定术，3种手术当中以前两项为主，最后一种手术因为极具破坏性，临床应用相对较少。
中医治疗主要以润泽鼻窍，减轻鼻腔干燥和结痂等为主。其主要方法包括针灸、按摩、服用中药或者是多种手段综合治疗，需要视患者的具体情况而定，不可盲目推崇某种治疗方法。
另外部分继发性的鼻炎患者还可以考虑使用糖皮质激素进行冲洗治疗，能够帮助患者抗炎、抗水肿以及抑制等，注意不建议患者进行糖皮质激素的注射，包括全身注射的和鼻腔局部的注射。
除了正规的治疗以外，日常的家庭护理也是治疗萎缩性鼻炎必不可少的一环。患者需要进行日常的鼻腔冲洗和润滑，一来要保证鼻腔内部的清洁，避免细菌滋生；二来也可以预防鼻腔内过度干燥加剧病情，延缓控制结痂等。
如果鼻腔内有顽固的痂皮，患者一定要去找专业的医生进行清除，不能自己动手，以免操作不当使得鼻腔出血，加重病情。